Historia Naruto zaczyna się, gdy Czwarty Hokage, jego ojciec, w obronie Konohy przed lisim demonem, o dziewięciu ogonach poświęca swoje życie, wiążąc przy tym bestię w ciele nowo narodzonego chłopca. Naruto może czerpać z niemalże nieskończonych pokładów chakry demona, a rany, które zdobywa po praktycznie każdej walce, goją się w oka mgnieniu. Kiedy w Naruto narasta gniew, czakra demona wydostaję się na zewnątrz i dodaję mu energię, jednocześnie gojąc mu rany. Pierwszy raz w dochodzi do tego w walce z Haku, kiedy rzekomo zabił on Sasuke. Pierwszym stadium tej zmiany są czerwone oczy demona, dłuższe paznokcie, które wtedy wyglądają jak pazury oraz powiększone kły. Im Naruto jest bardziej wściekły tym gorsze stadium przemiany. W następnym stadium czakra tworzy wokół niego powłokę lisa. Im więcej ogonów uformuję się z czakry, tym bardziej Naruto traci nad sobą panowanie i nie odróżnia przyjaciół od wrogów. Pierwszy raz widzimy tą przemianę podczas walki z Sasuke, kiedy ten zamierza dołączyć Orochimaru, a Naruto usiłuje go powstrzymać. Gdyby w tamtej walce wyrosło więcej niż tylko jeden ogon, przypuszczalnie Naruto mógłby nawet zabić Sasuke. Ostatnie stadium tworzy się kiedy powstaną cztery ogony. Skóra Naruto przypomina wtedy czakrę lub ogień, co powoduję że chłopak wygląda wtedy jak miniaturowa wersja Kyūbiego. Chłopak dochodzi do tej formy podczas walki z Orochimaru. Nie da się go wtedy powstrzymać i nic nie jest w stanie go zranić. Prawdopodobnie gdyby wyrosły wszystkie dziewięć ogonów, przez Naruto zaczął by przemawiać sam Kyūbi, tak jak to miało miejsce z Gaarą, kiedy ten zapadł w udawany sen.
Naruto nie wie nic o swoich rodzicach. O jego matce, której na imię Kushina Uzumaki nie wiadomo wiele oprócz tego, że pochodziła z (nieistniejącego już) Kraju Wiru i była żoną Minato.
Naruto wychował się w samotności, unikany przez mieszkańców wioski. Sam Czwarty Hokage pragnął, aby traktowano go jako bohatera, który uratował wioskę. Dotkliwe kary, które wprowadził trzeci Hokage za mówienie o przeszłości, powstrzymują starszych przed otwartą wrogością, jednakże ich niechęć w stosunku do Naruto przenosi się na jego rówieśników, którzy nie znają prawdy. Fakt ten bardzo martwi Sarutobiego, który podziela opinię swojego następcy i pragnie, aby Naruto żył wolny od uprzedzeń.
Sam Naruto dowiaduje się o zapieczętowanym w nim Kyūbim dopiero w wieku 12 lat, wcześniej sprawiwszy mnóstwo problemów wychowawczych (jednym z wielu jego pomysłów jest pomazanie wyrytych w skale głów Hokage farbą), chcąc w ten sposób zwrócić na siebie uwagę, gdyż nie zna on powodu, dla którego jest unikany. Namiastką ojca stał się dla niego Iruka Umino, nauczyciel z Akademii Ninja. Mimo że rodzice Iruki również zginęli podczas walki z demonem, jako jeden z pierwszych przezwycięża on swoje uprzedzenia i nie wini Naruto za ich śmierć, stając się w ten sposób jego pierwszym i najważniejszym przyjacielem oraz kimś w rodzaju ojca.
Do wyróżników jego osobowości należy hałaśliwość i umiejętność zaskakiwania oraz niczym nie zrażone przekonanie, iż któregoś dnia zostanie największym Hokage ze wszystkich. Osiągnięcie tego celu ma zapewnić mu uznanie mieszkańców Konohy, a żeby je zdobyć, Naruto trenuje bez wytchnienia.
Determinacja chłopaka, jego szacunek i lojalność względem przyjaciół oraz miłość do Konohy sprawiają, że przyciąga do siebie wielu ludzi. Z drugiej strony potrafi też być osobą momentami nieznośną i dziecinną, co przejawia się głównie we wspomnianym wcześniej hałaśliwym zachowaniu, wilczym apetycie oraz zamiłowaniu do śmiesznych przedmiotów (np. portmonetka-żabka lub piżama). Naruto posiada też wspaniały dar (jak nazwał to Kakashi) - każdy, kto go poznaje, zostaje jego przyjacielem.
Dalszy zarys [edytuj]
W Naruto: Shippūden po dwuipółletnim treningu z Jiraiyą powraca wraz ze swoim sensei do Konohy. Zaraz po powrocie do wioski przechodzi sprawdzian umiejętności (razem z Sakurą) walcząc z Kakashim. Jego pierwszą misją w nowo utworzonej drużynie Kakashiego jest uratowanie Gaary, który został porwany przez członków Akatsuki: Deidare i Sasoriego. Wraz z Kakashim walczy przeciwko Deidarze. W końcu odbija Kazekage z rąk członka Akatsuki i dowiaduje się, że on nie żyje. Skutkiem tego było ukształtowanie przez Naruto dwóch ogonów z chakry Kyūbiego, lecz zostaje on w porę powstrzymany przez Kakashiego. Ostatecznie (po walce z Deidarą) również udaje mu się z pomocą Chiyo przywrócić Gaarę do życia.
Po wykonanej misji wyrusza na kolejną, w której ma schwytać szpiega Sasoriego pracującego dla Orochimaru. Jednak tym razem z nowymi towarzyszami. Z powodu "kontuzji" Kakashiego, zostaje przydzielony nowy kapitan - Yamato, a miejsce Sasuke zajmuje Sai. Na miejscu okazuje się, że owym szpiegiem jest Kabuto. Po chwili pojawia się również sam Orochimaru. Dochodzi do walki między Sanninem a Naruto, który podczas starcia przyjmuje postać miniaturki Kyūbiego. Walka jest ciężka, ale ostatecznie Orochimaru (razem z Kabuto i Sai'em) się wycofuje, a Naruto zostaje przywrócony do normalnego stanu przez Yamato. Potem razem z drużyną rusza w pościgu za Sanninem oraz próbuje sprowadzić Sasuke z powrotem do Konohy. Niestety ta akcja się nie udaje, a Naruto niemal nie ginie z ręki młodego Uchihy. Po tym zdarzeniu Naruto razem z drużyną wraca do wioski.
Następnie podczas treningu z Kakashim i Yamato, tworzy nową oryginalną technikę stworzoną na podstawie Rasengana (przy treningu nad nowym jutsu pomagały mu jego cieniste klony, które znacznie przyśpieszyły czas ukończenia techniki). Nowa technika nosi nazwę Fūton: Rasenshuriken, która jest jednak ukończona jedynie w 50%. Dzięki niej pokonuje jednego z członków Akatsuki, Kakuzu, lecz sam zostaje poważnie ranny w rękę, ponieważ to jutsu działa również w drugą stronę. Niedługo potem dowiaduje się, że nie może używać tej techniki, ponieważ zagraża ona jego zdrowiu.
Następnie Naruto zostaje przydzielony do 8-osobowej drużyny, aby po raz kolejny spróbować sprowadzić Sasuke do Konohy. W czasie tych poszukiwań Naruto wraz z drużyną zostaje zatrzymany przez członka Akatsuki, Tobiego. Potem pojawia się Zetsu i mówi o pojedynku Itachiego z jego bratem Sasuke. Tobi zaprzestaje walki. Naruto wraz z drużyną próbuje dostać się jak najszybciej do półżywego Sasuke, zanim zrobią to Tobi i Zetsu. Niestety to przedsięwzięcie się nie udaje, ponieważ członkowie Akatsuki docierają szybciej do miejsca, w którym znajduje się młody Uchiha. Tym samym kolejna misja "uratowania" Sasuke przez Naruto nie powiodła się.
Następnie widzimy Naruto, który znajduje się w swoim domu i rozmyśla nad rozmową z Itachim, która miała miejsce chwilę przed walką braci Uchiha. Podczas tych wspominek dowiadujemy się także, że Itachi przekazał Naruto cześć swojej mocy, aby ten w przyszłości mógł ją wykorzystać, gdyby Sasuke chciał kiedykolwiek zaatakować Konohę. Chwilę później pojawia się Kakashi, który wzywa Naruto do biura Hokage. W drodze do siedziby Tsunade, Naruto spotyka Gamabuntę i Gamakichiego. Gdy już dociera do miejsca przeznaczenia spotyka drużynę siódmą oraz grupę żab przybyłych z góry Myouboku pod przywództwem Fukasaku (żaby Pa). Wtedy właśnie Naruto dowiaduje się od Pa i Tsunade o śmierci swojego senseia Jiraiyi zamordowanego z rąk Peina. Załamany opuszcza gabinet Hokage. Po drodze spotyka Irukę, który zaprasza go na Ramen, jednak Uzumaki odmawia. Następnie dochodzi do rozmowy między Naruto i Irukę, który pociesza głównego bohatera.